โรงเรียน มนร.วิทยานุสรณ์ มหาวิทยาลัยนราธิวาสราชนครินทร์ ตั้งอยู่บริเวณศูนย์ราชการนราธิวาส การเดินทางหากมาด้วยรถยนต์ส่วนตัวจากเส้นทางปัตตานี เมื่อถึงสี่แยกศูนย์บริการตรีเพชรอิซูซุ ให้เลี้ยวซ้ายเข้าศูนย์ราชการ จากนั้นขับตรงไปจนสุดทาง เมื่อถึงสามแยกให้เลี้ยวซ้าย ขับตรงมา มหาวิทยาลัยนราธิวาสราชนครินทร์จะอยู่ทางขวามือ เลี้ยวเข้าประตูหน้าและเลี้ยวขวาอีกครั้ง โรงเรียน มนร.วิทยานุสรณ์ จะอยู่ตรงข้ามอาคารคณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี